医学服务
医疗服务作为一种服务类产品,具有多种特性。科学、全面、准确地分析医疗服务产品的特性远的意义。
单细胞转录组测序
单细胞转录组测序
产品介绍

基于10X genomics平台,一次性能够分离500~10,000个细胞,并能够将分离的单个细胞的微量mRNA通过高效扩增后再进行高通量测序,有效的解决了组织样本无法破解的细胞异质性难题,有助于发现新的细胞类型;并基于大量的单细胞基因表达数据,可进行细胞表达特征聚类、亚群表达特征分析、标志物筛选等方面的研究。

技术流程

1 单细胞样本检测:

将样本制成单细胞悬浮液,用Countess® II Automated Cell Counter 进行细胞计数和细胞活率测定,细胞活性高于80%,并将细胞浓度调整到理想浓度1000个/μL。



2 文库构建

将制备好的单细胞悬浮液与含有barcode信息的凝胶珠以及酶的混合物结合,然后被位于微流体“双十字”液滴中进行液滴包裹,从而形成GEMs(Gel Bead-In-EMulsions),有效GEMs中,10X Barcode将与cDNA产物连接在一起,后续用于扩增质检。


单细胞转录组测序技术流程.jpg

3 测序分析:

进一步用illunima平台进行测序,获得每个细胞的基因表达数据。

分析内容

1 细胞分群:

其目的是为了进一步剖析样本的异质性

单细胞转录组测序分析内容.jpg

2 差异表达分析、鉴定亚群特征基因:

为了进一步确认较为理想的分群结果,并确认可能作为亚群的特征基因

单细胞转录组测序技术流程2.jpg3 差异基因功能注释富集分析:

包括GO注释富集分析、KEGG注释富集分析、疾病注释富集分析、转录因子注释、蛋白互作网络

单细胞转录组测序分析内容3.jpg

案例分析

单细胞转录组测序案例分析.jpg

单细胞转录组测序案例分析2.jpg

单细胞转录组测序案例分析3.jpg

进一步分析了在微环境中此类细胞的丰富度。并详细研究了肿瘤浸润性T淋巴细胞的多样性及其功能状态。


单细胞转录组测序案例分析4.jpg

通过对黑色素瘤开展的大规模单细胞转录组测序,系统研究了肿瘤内不同细胞亚群的组成、细胞亚群的功能以及肿瘤的微环境,为精准免疫治疗提供了参考。

返回列表